Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HECTD4Q9Y4D8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HECTD4Q9Y4D8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HECTD4Q9Y4D8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms