Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NRXN3Q9Y4C0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NRXN3Q9Y4C0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NRXN3Q9Y4C0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms