Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PRELID3BQ9Y3B1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PRELID3BQ9Y3B1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms