Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRG3Q9Y2Y8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRG3Q9Y2Y8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PRG3Q9Y2Y8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms