Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SIK3Q9Y2K2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK3Q9Y2K2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK3Q9Y2K2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms