Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SBNO2Q9Y2G9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SBNO2Q9Y2G9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SBNO2Q9Y2G9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms