Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ICE1Q9Y2F5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ICE1Q9Y2F5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ICE1Q9Y2F5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms