Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN8AQ9UQD0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN8AQ9UQD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN8AQ9UQD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms