Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTNND2Q9UQB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNND2Q9UQB3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms