Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNH4Q9UQ05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNH4Q9UQ05 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNH4Q9UQ05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNH4Q9UQ05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNH4Q9UQ05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms