Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPK3Q9UPE1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRPK3Q9UPE1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRPK3Q9UPE1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRPK3Q9UPE1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms