Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPT2Q9UMR5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPT2Q9UMR5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms