Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNOT6Q9ULM6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT6Q9ULM6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT6Q9ULM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms