Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNH3Q9ULD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNH3Q9ULD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KCNH3Q9ULD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNH3Q9ULD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms