Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LQ9UL33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms