Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF223Q9UK11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF223Q9UK11 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF223Q9UK11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms