Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HACL1Q9UJ83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HACL1Q9UJ83 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HACL1Q9UJ83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HACL1Q9UJ83 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms