Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO3A1Q9UIG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO3A1Q9UIG8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO3A1Q9UIG8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms