Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN3Q9UHW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN3Q9UHW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms