Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUFIP1Q9UHK0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUFIP1Q9UHK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUFIP1Q9UHK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms