Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHORDC1Q9UHD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms