Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO40Q9UH90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FBXO40Q9UH90 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO40Q9UH90 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms