Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL3Q9UH77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL3Q9UH77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL3Q9UH77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms