Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL13Q9P2N7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL13Q9P2N7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms