Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IGSF9Q9P2J2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IGSF9Q9P2J2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IGSF9Q9P2J2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms