Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLAIN2Q9P270 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLAIN2Q9P270 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SLAIN2Q9P270 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SLAIN2Q9P270 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLAIN2Q9P270 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms