Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC88CQ9P219 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC88CQ9P219 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC88CQ9P219 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC88CQ9P219 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms