Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFA13Q9P0J0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDUFA13Q9P0J0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1949.1 ms