Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CABP1Q9NZU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CABP1Q9NZU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CABP1Q9NZU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CABP1Q9NZU7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CABP1Q9NZU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CABP1Q9NZU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms