Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM53CQ9NYF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM53CQ9NYF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM53CQ9NYF3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms