Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN3BQ9NY72 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN3BQ9NY72 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN3BQ9NY72 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms