Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM260Q9NX78 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM260Q9NX78 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM260Q9NX78 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms