Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TOPORSQ9NS56 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TOPORSQ9NS56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPORSQ9NS56 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOPORSQ9NS56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms