Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
MYO5CQ9NQX4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MYO5CQ9NQX4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
MYO5CQ9NQX4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
MYO5CQ9NQX4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
MYO5CQ9NQX4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
MYO5CQ9NQX4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5CQ9NQX4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MYO5CQ9NQX4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5CQ9NQX4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
MYO5CQ9NQX4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms