Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEPEQ9NQ76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEPEQ9NQ76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEPEQ9NQ76 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms