Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCUBE2Q9NQ36 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCUBE2Q9NQ36 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCUBE2Q9NQ36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms