Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms