Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP13A2Q9NQ11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP13A2Q9NQ11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP13A2Q9NQ11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms