Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FANCFQ9NPI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCFQ9NPI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FANCFQ9NPI8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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