Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZDHHC4Q9NPG8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC4Q9NPG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC4Q9NPG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms