Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLCO1B3Q9NPD5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLCO1B3Q9NPD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms