Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CABP2Q9NPB3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CABP2Q9NPB3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CABP2Q9NPB3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CABP2Q9NPB3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CABP2Q9NPB3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms