Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNPLA8Q9NP80 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA8Q9NP80 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNPLA8Q9NP80 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms