Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGAP3Q9NP61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARFGAP3Q9NP61 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARFGAP3Q9NP61 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms