Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFT1Q9NNX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFT1Q9NNX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TUFT1Q9NNX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms