Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9N2J8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9N2J8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9N2J8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9N2J8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9N2J8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9N2J8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q9N2J8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9N2J8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9N2J8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9N2J8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9N2J8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9N2J8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9N2J8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9N2J8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9N2J8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9N2J8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9N2J8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9N2J8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9N2J8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9N2J8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9N2J8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9N2J8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9N2J8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9N2J8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9N2J8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9N2J8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9N2J8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9N2J8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9N2J8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9N2J8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9N2J8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9N2J8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9N2J8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9N2J8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9N2J8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9N2J8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9N2J8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9N2J8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9N2J8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9N2J8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms