Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMURF1Q9HCE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMURF1Q9HCE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF1Q9HCE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF1Q9HCE7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms