Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM27Q9HBJ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM27Q9HBJ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms