Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LY9Q9HBG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LY9Q9HBG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LY9Q9HBG7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LY9Q9HBG7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms