Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMYD3Q9H7B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD3Q9H7B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMYD3Q9H7B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD3Q9H7B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms