Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOJQ9H4E5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOJQ9H4E5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOJQ9H4E5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOJQ9H4E5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms